Israels energiminister Yuval Steinitz kom till Kairo för att närvara vid en regional konferens om naturgas, enligt källor på flygplatsen.
Det är ovanligt att så högt uppsatta israeler besöker Egypten.
Egypten och Israel slöt i februari i fjol ett avtal om överföring av naturgas, som har blivit en fråga av stor politisk, ekonomisk och strategisk tyngd i regionen.
– Steinitz inbjudan till konferensen i Egypten är en positiv följd av gasöverenskommelsen, säger en källa nära ministern.
Jordanien och Egypten är de enda arabländer som har fullt utbyggda diplomatiska band till Israel, men kontakterna är känsliga på grund av den israelisk-palestinska konflikten.
Senaste gången en israelisk minister var i Egypten var i november 2017 när Gila Gamliel, minister för social jämställdhet, deltog i en konferens om jämställdhet mellan könen.